Cada núcleo oferecerá disciplinas obrigatórias e um conjunto de optativas visando a formação do estudante e o embasamento teórico de seu trabalho de conclusão. O curso mantém a possibilidade da oferta de algumas disciplinas optativas a distância, preferencialmente na modalidade semipresencial.
Apenas a disciplina de Seminário de Pesquisa tem um pré-requisito que é a disciplina de Seminário de Projeto e ambas, respectivamente, são cursadas sequencialmente no ano de ingresso do estudante no programa. As demais disciplinas não têm pré-requisitos e poderão ser cursadas a qualquer época ao longo dos dois anos de duração do curso.
O aluno deverá cumprir os créditos em disciplinas no decorrer dos 24 meses de duração do curso, sendo importante que as disciplinas de formação não sejam separadas do processo de investigação e elaboração do trabalho de conclusão.
O leque de disciplinas obrigatórias e optativas (apresentado com a integralização dos créditos do núcleo UFABC do PROF-FILO) pode ser acessado aqui.